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不买最好,只买最贵!——Western Blot经验总结

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本文介绍常年Western Blot中各种选择经验。

Sigma ——土豪的选择,不买最好,只买最贵!


1. 抗体如何选择?
对于大部分实验室来说,选择抗体是一个比较头疼的问题:
买进口的太贵!
买国产的太需要勇气!
科研狗根据多年的经验总结出来如下的规律

Abcam: 品种全,质量较好,价格高,100ul只给你90ul。
Sigma: 价格忒贵忒贵的~一只100ul的flag抗体要9000,当然质量有保证,所以说土豪的选择。
CST: 性价比最高~你买100ul还送10ul, 缺点是抗体种类太少。
Santa: 多克隆抗体棒棒哒,单抗有风险,购买需谨慎。
国产抗体:不是贬低国产~而是真心不好用,可以用来做一些免疫组化啥的。
我们常常听到一个词叫做“进口分装”,其实不建议购买进口分装的,因为往往只能用一次,第二次用就不好使了。
如果你做的蛋白是自己最新发现的抗体,那么很可能还没有市场化的抗体,这个时候就需要自己做抗体了,抗体做的好的效价可达1:10000,当然一般是找公司做的,但是公司良莠不齐,做出来的结果也参差不齐。
2. 内参如何选择?
我们常用的内参一般有actin, tubulin,gapdh, 在这三个里面,推荐用GAPDH,在cell,nature上面的文章大都是用GAPDH做内参的,因为比较稳定,actin和tubulin有时候可能会出现复带。除非目的蛋白位置和GAPDH在同一位置,一般推荐用GAPDH,当然如果你使用其他的两个内参也非常好就不必换做GAPDH了。
3. 选择什么样的膜?
一般用到的膜有NC膜和PVDF膜,科研狗推荐用PVDF膜,他的好处是蛋白载量大,韧性好,PVDF膜的蛋白吸附能力很强,长时间电转也不会导致蛋白转过去。唯一美中不足的是用之前需要用甲醇泡之手一分钟,泡完甲醇之后还需要在电转液里面泡几分钟。
NC 膜是国内很多实验室喜欢用的膜,不能用甲醇处理, NC 膜有时候会使结果背景非常高。
除了 NC膜和PVDF膜,还有尼龙膜,当然NC膜和尼龙膜常用于核酸杂交。
除了类别外,膜还有不同孔径大小的,一般有0.45um和0.22um,根据科研狗的经验来说,20KD以下的蛋白采用0.22um的膜,本科研狗原先做caspase 3(17KD)的时候用过0.45um的膜,不过只用了80V电转了一个小时,但是这样导致上面的条带(50kd以上)的都没转到膜上去,如果你不需要上面的蛋白,可以选择0.45um的电转1h,如果你才用0.22um的,那么可以放心小蛋白也不会被电转出去。
4. 封闭方式的选择
一般我们采用的是脱脂奶粉封闭,也有用BSA封闭的,BSA封闭据说是会让非特异性变少,但是对比起来性价比太低,脱脂奶粉封闭效果也不差。奶粉看上去感觉很简单,但是作用很重要,如果选择不好,最终会导致结果漆黑一片,原因在于封闭不好,建议采用进口的脱脂奶粉。
5. 抗体孵育时间如何选择?
一抗我们可以采用室温孵育1-2h或者4度孵育过夜,两种方法各有优势,如果采用4度孵育过夜还想抗体回收利用,建议加入叠氮钠保护抗体,同时注意一抗用PBST/TBST洗膜的时候要洗干净,一般5X5分钟,因为叠氮钠的存在会影响到后面的辣根过氧化物酶的作用。如果你的抗体非常好使,建议室温1h,如果你的抗体结合不太容易,建议采用4度过夜。二抗一般都是室温1h,这个没有太多的选择。
6. 选择哪种方式发光?
目前国内实验室主流存在两种发光体系,一种是化学发光法(ECL),这种方法是灵敏度高,可以检测达pg级别的蛋白量,但是由于是酶促反应,不同曝光时间内得到的信号与样品量不成线性关系,不能做准确定量,这就是如果压片时间长一点,可能没有区别了,压片时间短一些就能看到区别了。
另外一种是荧光法,操作简单,荧光信号的强度直接反应目的蛋白的量,可进行较为精确的定量,同时可以在同一张膜上相近位置同时检测两种蛋白。比如两个蛋白一个分子量是53KD,另外一个是58KD,如果用ECL法很难区分,导致我们很可能需要跑重复平行的胶来区别,但是荧光法便可以采用红色荧光和绿色荧光来标记。当然荧光法的灵敏度不如化学发光,并且还需要购买专门的仪器(如odyssey)。
所以说,这个发光方式由不得你选择!
7. 化学发光法压片方式的选择
如果你们选择的是化学发光法(ECL),在暗室压片的时候,建议事先把X光片裁成比膜稍大,然后同时叠加放置5片X光片,直接压片4h,这样不管底物发光强弱如何,总能选择出一张合适的。相比较来说,可能我们更愿意先压片10min(或其他时间),然后发光根据强弱来决定第二次压片时间,但是这样往往会错过了最佳的时间。同时注意常常更换显影和定影液,因为最后一步也非常关键,再加上显影和定影液非常便宜。
总结:只买最好,不管贵不贵。往往我们采用一些质量不好的抗体或者试剂,导致实验需要推倒重来,综合算下来时间浪费,金钱浪费更加严重

来源:科研狗


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